O Estado do Rio de Janeiro se destaca historicamente pelas pesquisas sobre a química dos produtos naturais da biodiversidade brasileira. Criada em 2008, a Jornada Fluminense de Produtos Naturais foi idealizada a partir da necessidade de se criar um momento para a discussão das pesquisas realizadas no nosso estado, do conhecimento dos grupos de trabalho e do estabelecimento do  papel dessas pesquisas no cenário nacional. Com a temática “Em Busca de Produtos de Nossa Diversidade Biológica” a primeira e versão do Evento reuniu em abril de 2008, no Núcleo em Ecologia e Desenvolvimento Sócioambiental de Macaé (NUPEM) – UFRJ-Campus Macaé, cerca de 200 participantes. Neste Evento estiveram presentes representantes de todos os grupos de ensino e pesquisa na área de QPN e afins do Estado do Rio de Janeiro, além de representantes de todos os principais órgãos de fomento do país. 

Já na segunda edição, realizada em maio de 2012 no Instituto de Estudos do Mar Almirante Paulo Moreira (IEAPM) em Arraial do Cabo, o Evento contou com cerca de 220 pessoas e a presença de pesquisadores do Estado do Rio de Janeiro e São Paulo, além de pesquisadores internacionais da Colômbia e da Espanha. Em 2014, proposta inicial, o evento não foi realizado, entretanto, por grande vontade das pesquisadoras Alessandra Valverde (UFF) e Angélica Ribeiro Soares (NUPEM-Macaé), em 2016, o evento foi realizado na Universidade Federal Fluminense, e contou com diversos investigadores nacionais chagando ao número de 150 participantes. Com base na relevância desses Eventos para o desenvolvimento científico no nosso Estado e o significativo sucesso das edições anteriores, a proposta da IV Jornada Fluminense de Produtos Naturais (IV JFPN) é enfatizar e valorizar o estudo multidisciplinar na área de Química de Produtos Naturais inserido num cenário de conhecimento e valorização da biodiversidade brasileira, além disso, discutir a diversidade de Produtos Naturais na comunicação entre organismos.